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北京市第二中学亦庄学校是与北京二中合办的公办学校。北京市第二中学亦庄学校原名为北京经济技术开发区实验学校，建于1998年，由北京二中、史家胡同小学共同举办的民办学校。2011年4月15日，北京市大兴区教育委员会、开发区社会发展局正式启动全面提升北京经济技术开发区实验学校办学水平的工作；2011年9月起，实验学校转制为公办学校并更名为北京市第二中学亦庄学校。目前是集小学、初中、高中及国际高中为一体的十二年一贯制公办寄宿、走读学校。学校现有学生2920人，其中，小学1979人、初中501人、高中250人、国际高中190人，包括寄宿生360人；教职工345人，其中高级教师25人，中级教师86人。专任教师289人，特级教师4人，北京市骨干教师1人,大兴区骨干教师24人，大兴区学科带头人2人；博士后1人，博士1人，本科以上学历263人，外籍教师14人。学校占地9万平方米，已建成综合教学楼、图书馆、实验楼、餐厅、学生公寓、体育场和花园式中心绿地，办学硬件良好。
北京市第二中学亦庄学校一直肩负着北京亦庄国际高端产业新城基础教育配套功能的重要责任。学校以“为师生终身发展和幸福生活奠基”的“幸福教育”作为学校发展的灵魂，致力于为学生提供优质教育，发展学生个性，挖掘学生潜能，培养具有“中国情怀、世界眼光、科学素养、人文精神”的高素质人才。
北京市第二中学亦庄学校的发展归功于办学经验丰富、锐意进取、团结协作的管理团队和年富力强、业务精湛、乐于奉献的高水平教师队伍。王教凯校长对学校管理提出“细、精、准、稳、和”的五字方针，要求全体干部教师求是求实、有为有守、同心同德实现学校跨越式发展。学校重视队伍的可持续发展，致力于让教师拥有更多的幸福感、成功感、获得感；通过校内外、国内外培训平台提高教师专业素养；通过建立教师发展中心来实施名师工程、青蓝工程；强化师徒之间的传帮带作用，充分发挥特级教师、学科带头人、骨干教师引领、示范作用，使优秀教师与青年教师在教育教学实践中教学相长、共同提高。
北京市第二中学亦庄学校的飞速发展取决于科学化的教学和系统化的管理。从服务管理到教育教学管理等方面学校都做得严谨而扎实。学校以教改为契机，以提高课堂效率为核心，以“幸福教育”为主线，从课堂与课程两个维度立体化推进教学改革，全面提升内涵发展的质量。学校通过精细化管理，多种有效的管理措施，引导广大教师走进高效、和谐的幸福课堂，尊重个性，打造一支有尊严、幸福工作的教师团队,让学生感受学习的快乐和幸福。同时，学校立足师资及地域特点，弥补课堂教学不足，以丰富多彩的必修课程与校本课程构建幸福成长发展的课程体系。
北京市第二中学亦庄学校立足于学生个体成长，着眼于学生整体发展，依托其特色鲜明的地域优势，全方位实施特色教育和素质教育。学校开设加拿大国际高中部和美国国际高中部，为学生开通了赴美国、加拿大等国深造学习的通道。学校还组织师生赴美、加、英、日、韩等国交流学习，努力把学生培养成有国际视野、有跨文化沟通能力、有爱国热忱的“世界公民”。学校以打造拔尖创新人才培养工程为突破点，促进杰出英才脱颖而出。学校带领学生走进北师大数学科学实验室、北师大动力工程实验室、中科院动物研究所、生命科学院等，在专家的指导下完成科技创新作品，并在北京市青少年科技创新大赛中荣获一等奖。学校借助名校资源、高校资源、开发区高新企业的技术资源组建高科技实验室，学校被评为北京市科技教育示范校。学校金童爱乐合唱团、行进打击乐队均获得北京市一等奖，学校成立了“亦曲京韵”京剧社团的学生荣获“国戏杯”学生戏曲大赛三等奖，学校被评为大兴区艺术特色校。学校以跆拳道项目作为体育教育发展的龙头项目，校跆拳道队每年都有多人次获得全国比赛的金银牌，并将这一竞技性项目发展成惠及全体学生的群体性项目。学校被北京市教委批准为“北京奥林匹克教育学校体育后备人才培养基地”。校跆拳道队的基础上，学校组建了足球校队，致力于培养身体素质一流、道德品质高尚的高素质学生。
北京市第二中学亦庄学校凭借得天独厚的条件，以多种模式扩大优质资源。2014年9月，二中亦庄学校正式加入北京二中教育集团，在课程、管理乃至文化进行了全方位融合；二中教育集团为全校师生搭建了幸福发展的平台，推进各项工作在跨越式发展中寻求新的突破。2016年1月，原人大附中副校长王教凯出任二中亦庄学校新一任校长。王教凯校长之前在人大附中工作了十二年，将把人大附中的优秀办学理念、管理经验和优质资源引入学校的工作中。同时，为让优质教育资源辐射到更多的学校，人大附中联合总校也愿意与北京二中亦庄学校开展多维度的合作，为学校师生搭建一个高水平的学习交流平台。
北京市第二中学亦庄学校在十八年的发展历程中，广受认可与赞誉，获得北京市科研先进校、北京市学校文化建设示范校、北京市科技教育示范校、首都文明单位、北京市节约型示范校、北京市“团建十佳”创建工程标兵中学、北京市“千优带队”争创工作优秀校、北京市“五四红旗团委”称号、北京市少先队“星星火炬奖”、大兴区教育系统先进基层党组织、大兴区师德建设先进集体、大兴区艺术教育特色校、大兴区艺术教育、科技教育先进校等荣誉。国家总督学顾问、学校名誉校长陶西平先生，国家总督学、中国教育国际交流协会会长柳斌先生，国务院参事、国家教育咨询委员会委员、创新人才教育研究会会长、人大附中联合学校总校校长刘彭芝女士以及市区各级领导多次到校视察，对学校办学情况给予了充分肯定和高度评价。
北京市第二中学亦庄学校依托优良的教育教学基础和办学经验，在促进区域教育事业发展、满足北京亦庄国际高端产业新城的教育需求的同时，正以其卓越的教学管理和文化建设在高起点上实现着跨越式发展。相信在新一届领导班子团结务实、守正创新的领导下，在全体师生凝心聚力、奋勇拼搏的努力下，它必将成为北京南城名校。