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北京市木樨园体育运动技术学校的前身是1983年成立的四块玉体育训练基地，1993年迁至丰台区光彩北路4号，并正式更名为——北京市木樨园体育运动技术学校。1993年底，工体训练基地并入学校，1998年花样游泳队由先农坛迁入，学校规模不断扩大。目前，学校已成为北京市体育局最大的训练基地。

2016年12月，获得2016年“全国体育事业突出贡献奖”。

在北京市政府和体育局的大力支持下，学校投资近两亿元人民币进行硬件设施的建设，使得训练条件和训练环境达到了国内一流水准。学校现有光彩体育馆、游泳馆、综合训练馆(含健身房、室内垒球训练馆)、手球训练馆、排球训练馆、田径场（含垒球场）等，共计5万平方米。其中，面积达800平方米的垒球训练馆是国内唯一的室内垒球训练馆。新建的运动员公寓12747 平方米，同时，学校配有运动员餐厅、医务室、图书阅览室、游戏厅、多功能厅等辅助设施，为运动员提供了良好的食宿、医疗康复、文化娱乐条件。

学校现有垒球、手球、排球、男子柔道、摔跤、游泳、跳水、花样游泳等八个奥运会项目，12支运动队，教职员工共计700多人。曾先后培养出（按姓氏笔画）王睿、李娜、贡明、张艳红、陈琳、郎平、杨晓君、晁娜、梁小桥、韩雪等多名世界冠军。2000年第27届奥运会，跳水运动员李娜获得女子10米双人跳台第一名，女子10米跳台第二名，实现了学校跳水项目夺取奥运金牌零的突破。

木樨园体育运动技术学校为北京和国家的竞技体育事业做出了重要贡献。